却说神农氏要将轩辕带回陈都，有熊部落众人对此皆是高兴不已。而广成子也马上得知了此事，心中大喜过望。既然神农氏如此作为，那便是认可了轩辕的才能，准备将共主之位传与轩辕，如此广成子又怎能不让过广成子高兴呢？如此一来，轩辕的人皇之位便已定下，只要一想到轩辕证得人皇之位以后，自己定然也会得到不少的功德。到时，也可像龟灵圣母一般，斩尸成为准圣。这可是准圣啊！便是在整个洪荒世界之中也是屈指可数，想到自己也将成为其中一员，指点江山，挥斥方遒，广成子心中便忍不住激动万分。于是，广成子思考一番，便随着神农氏一众人也去了陈都。
众人一路行来，很快便到了陈都。安排一番之后，神农氏便照伏羲传位与自己之时的流程一样，让轩辕先做自己三年的副手，也好熟悉人族共主之责。而三年之后便是轩辕继任人族共主之时。
三年转眼即过，如今也到了轩辕即位为人族共主之时了。仍是陈都之外的那座高台之上，唯一不同的乃是人如今已变成了神农氏与轩辕，而不再是伏羲与神农氏了。而一立于一旁的人也由六耳变成了孔宣。
高台之下，前来观礼的人族，比起伏羲传位神农氏之时又增加了许多。却是人族经过人皇神农氏的引导，如今已是又迈进了一大步，人口增加无数，无论人数还是实力，人族此时已是洪荒大陆之中当之无愧的第一大族了。
此高台自上次人皇传承之后，便于高台之上立下三尊圣人之像，依次供奉着女娲娘娘，帝江祖巫，太清老子。神农氏与轩辕走上高台。神农氏望了一眼轩辕，对其点点头，然后二人便一同上前，向高台上所供奉的三位圣人祷告。
片刻之后，只见天空无数金花凝结、撒下，接着，天上出现了七个身影。却是帝江、后土、女娲、老子、通天和原始六人驾临，而最后一位自然就是天皇伏羲了，人族的人皇接位仪式，身为上届人皇的他怎可不来？而原始天尊此次前来，乃是因此次接位的人皇是其徒孙，自然要前来为其助阵。倒是西方二圣此番并未前来，不是他们不想来，实在是没时间啊，好不容易换得一尊人皇之师，当然要好好珍惜，当初离开蓬莱岛后，二人便专心教导起了他们门下唯一一个有望斩尸的弥勒，也就是以后佛教的未来佛。
众人见此，赶忙纷纷跪下道：“拜见圣母，拜见伏羲共主，拜见帝江祖巫、后土娘娘、太清圣人，上清圣人。”而对于原始天尊，众人族却是只闻其名，不知其人，如今见了，却也不认识，因此也未曾拜见。
原始天尊见此，顿时脸色一阵阴沉，有些恼怒。转而一想，心中又有些后悔，上次人皇交接，自己未曾前来却是失策了。如今众圣在人族之中的威望，原始天尊可以说是在最低的，甚至连接引准提都比之不上，这让原始天尊不禁开始反思自己的一些作为。不过，原始马上便将此念头抛出脑中，让他原始天尊承认错误，怎么可能。
人族自然不会知晓原始天尊所想，全部拜倒在地。女娲娘娘见此，便上前说道：“无需多礼，尔等起身。”说罢，素手一挥，众人便被扶起。然后，女娲等七人来到高台之上，帝江对神农氏点了点头，说道：“开始。”
神农氏恭敬的回道：“是。”
于是，神农氏走到高台边上，大声道：“吾乃神农氏，近来吾渐感精力有些衰退，已经不再适合担当人族共主之位，今天吾正式在此将人族共主之位禅让于人族大贤，有熊部落族长轩辕氏。从今天开始，轩辕将正式成为人族共主，带领人族继续前进。”
高台之下的人族，在神农氏说完后，顿时开始齐声高呼神农氏和轩辕的名字，与上次伏羲的情况一般。在人族众人大声高呼神农氏和轩辕名字之时，只见天外射来一道粗壮的功德金光，此次功德金光之多，甚至还在伏羲之上。
功德降下之后，分成两份，其中一大份约有八成，归了神农氏；剩下的一小份约有两成，归了孔宣，顿时，二人便被功德金光包围。孔宣在功德临身之后，灵台一阵空明，平时模糊的大道，如今尽在眼前，清晰无比。只见孔宣显出庆云，庆云之上气浪翻滚，三花绽放，一阵豪光闪过，从庆云之上跳下一人，对孔宣施礼道：“恭喜道友斩去善尸，得成准圣，却是大道可期。”
孔宣微微笑道：“道友与我一体，自当同喜。”那道人微微一笑，然后便化作一道流光飞入孔宣身体，消失不见。帝江和后土见金灵圣母斩尸，皆是大喜，面露微笑。
一旁的老子见孔宣斩尸，淡淡看了他一眼，便不去理会，可此时老子心中到底如何，众人就无法知晓了。而老子身旁的原始天尊则是嫉妒的望了一眼孔宣，脸色有些不好看。不过瞬间，原始天尊便想到此次人皇乃是自己徒孙，于是，原始拿眼望向轩辕，眼中的炙热不必三昧真火差上多少，足以融化万物，而通天也是心头火热，等到五帝之时，自己门下也会出现一位准圣，到时截教威信必定大涨。
此时，神农氏也终于将功德吸收完毕，只见一阵金光闪烁之后，神农氏却是已经证得了人皇之位。同伏羲一般，从此万劫不磨，无量量劫不灭，而此时他也是恢复了前世记忆，他的前世便是红云老祖，人皇职位便是帝江答应他的机缘，红云此时心中感慨万千，心中想到：“从此再无红云老祖，只有人皇神农氏。”。
台上众人见此，便一同上前，向神农氏祝贺，神农氏赶忙一一还礼。帝江看了一眼神农氏，对其说道：“神农氏，吾知你心中一直放不下精卫。呵呵，你不必忧心，精卫如今早已恢复，正在蓬莱岛上修炼，吾打算使其日后长居于蓬莱岛之中，与你老师孔宣作伴。你却是不必着急，日后，自有相见之日。”
神农氏一听，顿时大喜过望，对帝江拜谢道：“神农氏代女娃谢过师祖大恩。”帝江却挥了挥手，示意神农氏不必客气。救助精卫对他而言本就是举手之劳，而且他自己也是很喜欢精卫这个乖巧的小女孩。不过神农氏称呼精卫为女娃，想来是精卫的小名，想到精卫那可爱的样子，帝江不由的微微一笑，自己妹妹后土生性平淡，但对精卫却是十分疼爱，有精卫相陪，后土的生活也是多彩了一些。
这时，老子上前对众人道：“如今三皇齐聚，吾便于此宣布一事。人族三皇却是不可皆以人皇称之，如此，吾便为其命名。”顿了顿，老子接着说道：“伏羲感天道运转，创出八卦，使人族知天时，明灾祸，如此便为天皇；神农氏种植五谷，遍尝百草，使人族饥有所食，病有所医，如此便为地皇；而如今的轩辕，可为人皇，尔等三皇证道之后，皆于火云洞之中隐居，从此无大事不可轻出。”这便是后世天地人三皇的由来。
伏羲、神农氏和轩辕赶忙答应。
老子点了点头，然后便与众人告别，与原始天尊一同驾云离去。通天看着一同离去的老子原始二人，眼中精光闪烁，心中不知在想些什么，之后也是一人独自离去。二人如今明显已是联合在一起，否则，以原始天尊得罪老子的程度，又怎会如此亲密。
二人为何联合，通天早已知晓，帝江后土未曾立教，日后也不会有什么道统之争，而自己的截教则是在人族的威望比人阐两教都好，恐怕将来定然会有一战。
此时，帝江心中也是思绪万千，可并未表露出来，在老子原始二人以及通天离去之后，帝江与后土也向众人告辞，一同朝东海而去。女娲娘娘见众圣皆已离去，也自顾自回娲皇宫去了。
伏羲和神农氏见众圣离去，人皇交接也已完成，神农氏上前对轩辕笑道：“皇弟，人族便交给你了，吾与皇兄在火云洞等你。”说罢，也不待轩辕答话，便与伏羲驾云朝火云洞飞去。
轩辕一听神农氏所说，也不顾伏羲神农氏二人早已飞远，当即跪倒在地大声道：“轩辕定当不负二位共主所托，当竭尽全力守护人族。”众人族也皆是拜倒在地，恭送二位人皇。直到二人消失于天际，众人族才起身。
自此，人族进入了人皇轩辕时代。
回到蓬莱岛之后，后土便被精卫缠上了，帝江看着玩闹的精卫和后土脸上的笑容，心中想到，这便是我要守护的，没有打搅她们，帝江自己回到了祖巫殿中，坐下之后，便陷入了沉思，过了几个时辰，帝江手中射出几道清光，之后便又开始沉思起来。
只一会，一个十岁左右大小的小男孩便走进大殿之中，开口便说道：“师傅，人家在睡觉，不知道我在长身体吗？”帝江一听苦笑：“当初怎么会收你这个懒虫为徒呢，师门不幸啊。”
这个小孩正是玄龟，玄龟笑道：“师傅还是看重人家资质万众无一嘛，呵呵呵。”看着玄龟一张纯真的小脸，便说道：“好了，这次叫你来有时要你去做，现在··”玄龟马上叫了起来：“啊，师傅，人家还是小孩子，你这是虐待儿童，我要告诉师叔。”说完便想跑出去，帝江一听手一挥，便将玄龟抓了回来，笑道：“呵呵，是好事情，你不是不喜欢修炼吗，这次的事只要办好了，不仅修为会长，同时师傅还给你一段时间的假，让你好好睡觉，怎么样？”
玄龟半信半疑地问道：“真的？”帝江笑道：“当然，不过你要带着小精卫一起去，怎么样？”玄龟歪着小脑袋想了一会，便说道：“好吧，师傅你要敢骗我，我就去师叔那告状。”
帝江一听玄龟的威胁，不由眼角抽动，没办法啊，谁叫玄龟和精卫两个长得可爱呢，后土对二人可是喜欢的紧，岛上可没人敢惹他们，就是帝江也是不敢，上次帝江逼着玄龟修炼，后来玄龟告到后土那，帝江没少被后土说，之后帝江也就不再比玄龟修炼了。
见玄龟答应便有叫来精卫，给了几样东西他们，又教了他们一些事，之后两个小娃娃便高高兴兴地走出了祖巫殿，看着两个小娃娃的身影，帝江不由笑道：“史上最年轻的高手，呵呵。”之后身上闪出一道青光，跟上玄龟和精卫。
却说人族于洪荒之中有个大部落，乃是由畎夷、于夷、方夷、黄夷、白夷、赤夷、玄夷、风夷、阳夷九个部落组成，合称九黎或九夷，每个部落之下，还各有九个氏族，共计八十一个，人口之繁盛，实力之庞大。当有熊轩辕降生过后不久，九黎也得了一子，生有一十七斤重，七岁方出口能言，自改名姓为蚩尤，长至如今已是十三岁，身高两丈，不拜天地，不尊圣人，不修世间道法，天生便有千钧神力，徒手撕裂虎豹犹如儿戏，一身凶悍煞气，洪荒异兽亦是不敢招惹于他。如此武勇，族长黎素来看重，有意立其为继位人选。
这蚩尤却是巫族大巫转世，原本蚩尤在巫妖决战之后并未身陨，可惜蚩尤一直未有发现，他本身早已中了一妖族大妖临死之际的舍命一击，此大妖乃是一条剧毒之蛇化形。
在巫妖决战之时被与蚩尤大战，可惜及不如人，被蚩尤打成重伤，此大妖见生还无望，便将自己化形之时脱落下的毒牙，也不管蚩尤的攻击，舍命刺向蚩尤，蚩尤虽将其打杀，可也被毒牙划破了手臂，那时，正是巫妖大战之时，此等小伤蚩尤自然没放在心上，稍稍一顿，便又杀向妖族。
可蚩尤却是未曾想到，此大妖本就为毒蛇化形，他所脱落的牙齿之上自然含有剧毒，只不过此剧毒并未直接发作，而是慢慢潜伏在蚩尤体内。因此，蚩尤当时并未感觉有何不适。而巫妖大战之后，巫族大部分族人全部退回地府之中，而剩下一部分却是回到洪荒大陆，看守着盘古殿，蚩尤也是这看守盘古殿的众多巫族之中的一人。
可惜好景不长，蚩尤在盘古殿之中感觉自己的身体越来越不好，时常有些头晕目眩，看东西也是颠三倒四，不甚真切。蚩尤认为自己因巫妖大战，过于疲惫，所以才会如此。于是，蚩尤便与众人说了一下，自己需要多多休息了一番。可蚩尤休息的时日越来越长，众人见此事怪异，皆劝其去地府找祖巫看看，可蚩尤却不同意，众人无奈，只好由着他。
这一日，巫族众人见蚩尤已是睡了好些日子了，可却还未出来，便去蚩尤的房间找他。进入房间一看，顿时全部惊呆了，只见蚩尤此时七窍流血，双目圆睁，躺在床上一动不动。众人稍稍呆了一会儿，赶忙上前查看，可惜蚩尤已是死去多时。众巫族心中大悲，巫族如今人数已大不如从前，虽然大巫还有不少，可偏偏陨落的事一位顶级大巫，不过众人对此也是无奈，只能收拾心情，将蚩尤埋葬于盘古殿之外。
蚩尤死去之后，真灵并未消散，被吸入六道轮回之中转世成人。蚩尤转世之后得成人身，七岁之时，蚩尤灵智大开，明了前世种种。他却也是不甘寂寞之人，虽说数年来处心积虑，继任九黎族长之位并不为难，但一念及巫族式微，实是生平一大恨事，思来想去，不若召集巫族余众，壮大九黎一族，到时征战杀伐，一统洪荒人族，巫族固然可以重兴，占得人族高位，自己更是独霸人皇之位，岂不快哉？
于是，蚩尤拜别黎，道是寻访高人壮士以助九黎，便前往盘古殿寻一众巫族而去。